主實驗室與輔助實驗室的主要區別體現在功能和用途上：

主實驗室

主實驗室是進行分析、研究等核心實驗的主要場所。它通常配備有精密的儀器和設備，用于執行關鍵的實驗步驟和數據采集。例如，在生物安全實驗室中，主實驗室往往是污染風險最高的區域，通常包含生物安全柜、動物隔離器等關鍵設備。此外，樣品處理實驗室、微生物培養室、觀察室等也屬于主實驗室的范疇。

輔助實驗室

輔助實驗室則是為實現核心實驗而設置的輔助性實驗室。它們通常用于準備實驗材料、儲存樣品、進行預處理或后處理等工作。輔助實驗室的設備可能相對簡單，但同樣對實驗的順利進行至關重要。常見的輔助實驗室包括天平室、高溫室、樣品室等。這些實驗室為主實驗室提供了必要的支持和保障，確保了整個實驗過程的順利進行。