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PCR實驗室設計與建設中應注意的問題_四川華銳-北京實驗室裝修公司

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北京PCR實驗室設計與建設中應注意的問題
發(fā)布時間:2019-05-29 01:21:26瀏覽次數(shù):11050

一、什么是PCR實驗室

 PCR是聚合酶鏈式反應(PolymeraseChainReaction)的簡稱。聚合酶鏈式反應也可以當作一項極其重要的酶促合成DNA技術。PCR又稱為無細胞克隆系統(tǒng)或特異性DNA序列體外引物定向酶促擴增法,是基因擴增技術的一次重大革新,它可將極微量的靶DNA特異地擴增上百萬倍。
 聚合酶鏈反應(PCR)是在DNA聚合酶催化下,以母鏈DNA為模板以特定引物為延伸起點,通過變性、退火、延伸等步驟,體外復制出與母鏈模板DNA互補的子鏈DNA的過程。是一項DNA體外合成放大技術,能快速特異地在體外擴增任何目的DNA。可用于基因分離克隆,序列分析,基因表達調(diào)控,基因多態(tài)性研究等許多方面。
 一對合成DNA的引物經(jīng)過高溫變性、低溫退火和中溫延伸三個階段為一個循環(huán),每一次循環(huán)使特異區(qū)段的基因拷貝數(shù)放大一倍,一般樣品是經(jīng)過30次循環(huán),最終使基因放大了數(shù)百萬倍;將擴增產(chǎn)物進行電泳,經(jīng)溴化乙錠染色,在紫外燈照射下肉眼能見到擴增特異區(qū)段的DNA帶。
二、設計要點
1、主體結構:
 目前實驗室的主體多為彩鋼板、鋁合金型材。室內(nèi)所有陰角、陽角均采用鋁合金R50內(nèi)圓角鋁,從而解決容易污染、積塵、不易清掃等問題。并且彩鋼板結構牢固,線條簡明,美觀大方,密封性好。
2、標準的四區(qū)分隔和氣壓調(diào)節(jié):
 將PCR過程分成試劑準備、標本制備和PCR擴增區(qū)及產(chǎn)物分析檢測區(qū)四個獨立的實驗區(qū)。整個區(qū)域有一個整體緩沖走廊。每個獨立實驗區(qū)設置有緩沖區(qū),同時各區(qū)通過氣壓調(diào)節(jié),使整個PCR實驗過程中試劑和標本免受氣溶膠的污染并降低擴增產(chǎn)物對人員和環(huán)境的污染。
3、消毒:
 在四個實驗區(qū)和四個緩沖區(qū)頂部以及傳送窗內(nèi)部安裝有紫外燈,供消毒用。在試劑準備區(qū)和標本制備區(qū)還設置移動紫外線燈,對實驗桌進行局部消毒。
4、機械連鎖不銹鋼傳遞窗:
 試劑和標本通過機械連鎖不銹鋼(不建議使用電子連鎖方式)傳遞窗傳遞,保證試劑和標本在傳遞過程中不受污染(人物分流)。
5、地面
 地面建議使用PVC卷材地面或自流坪地面,整體性好。便于進行清掃,耐腐蝕。沒有條件的也可采用水磨石地面,或大塊的瓷磚(至少800mm×800mm)接縫需要小于2mm。
6、照明
 燈具要選用凈化燈具,能達到便于清洗、不積塵的特點。另外:
?PCR實驗室可分為兩個大的功能工作區(qū)域:核酸擴增前區(qū)和核酸擴增后區(qū)。核算擴增前區(qū)包括試劑準備間和樣本制備間,這個兩房間各自獨立,不能出現(xiàn)空氣互通,這兩個房間相對外界氣壓呈正壓狀態(tài)。核酸擴增后區(qū)包括擴增區(qū)和產(chǎn)物分析區(qū),使用實時熒光PCR儀、HIV病毒載量測定儀的PCR實驗室,這個兩區(qū)域可以合并為一個房間。這個區(qū)域如果是分開兩個房間,這兩個房間也必須是各自獨立,不能出現(xiàn)空氣互通。核算擴增后區(qū)對外界氣壓呈負壓狀態(tài)。
 PCR實驗室根據(jù)使用儀器的功能合理設置各個工作區(qū)域,如采用聚合酶聯(lián)反應:則設置試劑儲存和準備區(qū)、標本制備區(qū)、擴增區(qū)、擴增產(chǎn)物分析區(qū)四個單獨的工作區(qū)域,這是最常用的分區(qū)方式。樣品需要粉碎處理的,還需增設樣品粉碎區(qū);若使用實時熒光PCR法:基因擴增區(qū)、基因產(chǎn)物分析區(qū)可以合并在一個房間內(nèi);采用標本處理、核酸提取及擴增檢測為一體的全自動化PCR分析儀,則標本制備區(qū)、擴增區(qū)、擴增產(chǎn)物分析區(qū)可合并為一個區(qū)域,因此PCR實驗室原則上設置五個區(qū)或四個區(qū)或三個區(qū)或二個單獨的工作區(qū)。
 核酸擴增前區(qū)和核酸擴增后區(qū)可設在一個房間內(nèi),但必須在滿足下列要求的前提下:
a.核酸擴增前區(qū)實驗室內(nèi)設置兩個不同位置的實驗區(qū),試劑配置在超凈工作臺中操作,樣品處理在生物安全柜內(nèi)操作。
b.在核酸擴增后區(qū)使用全封閉的擴增和檢測系統(tǒng),如實時熒光PCR儀等。
c.每個實驗人員使用各自的試劑、耗材、移液器和盛放污染物的盛器。
d.在實驗前后對操作區(qū)域和共享器具進行清潔及消毒。
e.各區(qū)域的試劑、器具、儀器和設備為該區(qū)專用,不得交叉使用。
三、空氣流與壓差要求
 PCR實驗室的空氣流向必須嚴格按照試劑儲存和準備區(qū)→標本制備區(qū)→擴增區(qū)→擴增產(chǎn)物分析區(qū)空氣壓力逐漸遞減方式進行,防止擴增產(chǎn)物順空氣氣流進入擴增前的區(qū)域。風速流向不得混亂。
 為了保證房間內(nèi)的壓差和避免污染,應在空調(diào)面板處寫清楚送風機和排風機的開啟順序和關閉順序,先后順序不得混亂。
 空氣潔凈級別不同的相鄰房間之間的靜壓差應大于5帕,潔凈室(區(qū))與室外大氣的靜壓差應大于10帕,應配備監(jiān)測靜壓差的設備,并定期監(jiān)控。
 一般情況下,試劑配制室及樣品處理室宜呈微正壓,以防外界含核酸氣溶膠的空氣進入,造成污染;可以通過控制進風風量大于排風風量達到正壓效果。
 核酸擴增室及產(chǎn)物分析室應呈微負壓,以防含核酸的氣溶膠擴散出去污染試劑與樣品,可以通過控制排風風量大于進風風量達到負壓效果。
 在理想情況下,PCR實驗室緩沖間內(nèi),可設置正壓,使室內(nèi)空氣不流向室外,室外空氣不流向室內(nèi)。PCR實驗室進風由原有中央空調(diào)控制的要求將中央空調(diào)風口安裝到指定定點。
四、實驗室面積及設備間距
 一般來說各房間的面積沒有嚴格要求,只需能放置所需儀器設備,并且便于人員操作即可,但是有生物安全柜的房間面積不能小于10平米,并且每增加一臺生物安全柜,房間就要增加10平米。
 各實驗室緩沖間的面積一般為1300*(1300或1500)mm為宜,并且緩沖間的面積不能大于實驗室房間面積的1/8。
 在做平面設計的時候,首先要考慮的因素是就是“安全”,實驗室是最易發(fā)生爆炸、火災、毒氣泄露等的場所。我們在做平面設計的時候,應盡量地要保持實驗室的通風流暢、逃生通道暢通。根據(jù)國際人體工程學的標準。我們做如下的劃分以供參照:實驗臺實驗臺通道劃分標準(通道間隔用L表示)L>500mm時,一邊可站人操作;L>800mm時,一邊可坐人操作;
L>1200mm時,一邊可坐人,一邊可站人,中間不可過人;
L>1500mm時,兩邊可坐人,中間可過人;
L>1800mm時,兩邊可坐人,中間可過人可過儀器
 天平臺、儀器臺不宜離墻太近,離墻400mm為宜。為了在工作發(fā)生危險時易于疏散,實驗臺間的過道應全部通向走廊。另:實驗室建筑層高宜為3.7米-4.0米為宜,凈高宜為2.7米-2.8米,有潔凈度、壓力梯度、恒溫恒濕等特殊要求的實驗室凈高宜為2.5米-2.7米(不包括吊頂);實驗室走廊凈寬宜為2.5米-3.0米.普通實驗室雙門寬以1.1米-1.5米(不對稱對開門)為宜,單門寬以0.8米-0.9米為宜。
五、潔凈裝修要求
 潔凈室(區(qū))的內(nèi)表面應平整光滑、無裂縫、接口嚴密、無顆粒物脫落,并能耐受清洗和消毒,墻壁與地面的交界處宜成弧形或采取其他措施,以減少灰塵積聚和便于清潔。
 潔凈室(區(qū))內(nèi)各種管道、燈具、風口以及其他公用設施,在設計和安裝時應考慮使用中避免出現(xiàn)不易清潔的部位。
 潔凈室(區(qū))的窗戶、天棚及進入室內(nèi)的管道、風口、燈具與墻壁或天棚的連接部位均應密封。
六、工作服要求
 在凈化車間內(nèi)工作的人員應穿著符合要求的工作服。工作服的選材、式樣及穿戴方式應與生產(chǎn)操作和空氣潔凈度級別要求相適應,并不得混用。潔凈工作服的質(zhì)地應光滑、不產(chǎn)生靜電、不脫落纖維和顆粒性物質(zhì)。無菌工作服必須包蓋全部毛發(fā)、胡須及腳部,并能阻留人體脫落物。不同空氣潔凈度級別使用的工作服應當分別清洗、整理,必要時消毒或滅菌。工作服洗滌、滅菌時不應帶入附加的顆粒物質(zhì)。工作服應制定清洗周期。
 進入各個區(qū)域必須嚴格按照單一方向進行,不同的工作區(qū)域使用不同的工作服(例如不同的顏色)。工作人員離開時,不得將工作服帶出。
 實驗室應建立、執(zhí)行人員進出潔凈區(qū)的清潔程序和管理制度,人員清潔程序合理。
七、人流路徑與物流路徑
 進入實驗室區(qū)域工作人員應該按照以下路徑:
 公共清潔區(qū)——更衣間(更換潔凈服)——緩沖間——污染實驗區(qū)
 工作人員退出實驗室的路徑為:
 污染試驗區(qū)——緩沖間——淋浴間(有條件的可設置)——更衣間——公共清潔區(qū)所有的物品進入實驗區(qū)必須經(jīng)過雙扉互鎖傳遞窗,利用傳遞窗消毒后才可進入,實驗室內(nèi)所有物品的也必須經(jīng)過傳遞窗才可以傳遞到實驗室以外的清潔公共區(qū)。
八、門的開啟方向
 實驗室建筑層高宜為3.7米-4.0米為宜,PCR實驗室凈高宜為2.5米-2.7米(不包括吊頂);實驗室走廊凈寬宜為2.5米-3.0米.普通實驗室雙門寬以1.1米-1.5米(不對稱對開門)為宜,單門寬以0.8米-0.9米為宜。
 一般實驗室門主要向里開,但如有危險的房間,房門應朝外開,房門材質(zhì)最好選擇壓力玻璃。
 有壓差梯度的房間,門的開啟方向應朝向正壓方向一側開啟;
 考慮到消防安全,對于那些主要逃生門的開啟方向應朝向清潔區(qū)方向開啟。
九、基本儀器設備考慮
(1)試劑貯存和準備區(qū)
 該實驗區(qū)主要進行的操作為貯存試劑的制備、試劑的分裝和主反應混合液的制備。試劑和用于樣品制作的材料應直接運送至該區(qū),不得經(jīng)過其他區(qū)域。試劑原材料必須貯存在本區(qū)內(nèi),并在本區(qū)內(nèi)制備成所需的貯存試劑。對與氣流壓力的控制,本區(qū)應對外界保持微正壓。
 試劑準備區(qū)儀器設備主要應有加樣器、冰箱、天平、低速離心機、混勻器、可移動紫外燈等。可使用超凈工作臺作為試劑配制操作臺面。
(2)標本制備區(qū)
 該區(qū)域主要進行的操作為樣本的保存、核酸(RNA、DNA)提取、貯存及其加入至擴增反應管和測定DNA的合成。本區(qū)的壓力梯度要求為:相對于鄰近區(qū)域為正壓,以避免從鄰近區(qū)進入本區(qū)的氣溶膠污染。另外,由于在加樣操作中可能會發(fā)生氣溶膠所致的污染,所以應避免在本區(qū)內(nèi)不必要的走動。
 標本制備區(qū)儀器設備主要應有生物安全柜(最好為B2,可避免提取核酸在柜內(nèi)反復循環(huán),造成標本間交叉“污染”,出現(xiàn)假陽性結果。此外還應配備加樣器、臺式高速離心機(冷凍及常溫)、臺式低速離心機、恒溫設備(水浴和/或干浴儀)、冰箱、混勻器和可移動紫外燈等。
(3)擴增和擴增產(chǎn)物分析區(qū)
 該區(qū)域主要進行的操作為DNA擴增和擴增片段的測定。此外,已制備的DNA模板(來自樣本制備區(qū))的加入和主反應混合液(來自試劑貯存和制備區(qū))制備成反應混合液等也可在本區(qū)內(nèi)進行。本區(qū)的壓力梯度要求為:相對于鄰近區(qū)域為負壓,以避免氣溶膠從本區(qū)漏出。為避免氣溶膠所致的污染,應盡量減少在本區(qū)內(nèi)的不必要的走動。個別操作如加樣等應在超凈臺內(nèi)進行。
 擴增區(qū)主要儀器就是核酸擴增熱循環(huán)儀(PCR儀,實時熒光或普通的)。熱循環(huán)儀的電源應專用,并配備一個穩(wěn)壓電源或UPS,以防止由于電壓的波動對擴增測定的影響。此外,根據(jù)工作需要,還可配備加樣器、超凈臺等。
 產(chǎn)物分析區(qū):本區(qū)所使用的儀器設備可能有加樣器、電泳儀(槽)、電轉印儀、雜交爐或雜交箱、水浴箱、DNA測序儀、酶標儀和洗板機等。
十、實驗室風量測算
1、排風量的計算方法:
 根據(jù)面風速來確定排風量(面風速的一般取值為:0.3~0.5m3/h)計算公式:
G=S•V•h•μ=L•H•3600•μ
十一、安全注意問題
A、生物安全柜的擺放位置不易擺放在與出入口緊鄰的墻體上;
B、實驗室內(nèi)的通訊設施應該放置于生物安全柜對面;
C、實驗室門口位置設置緊急洗眼器和緊急噴淋,以防止實驗人員受到傷害;
D、高壓滅菌器應與傳遞窗緊鄰;
E、實驗室內(nèi)的壓力顯示器和報警裝置都應放置在醒目位置;
F、與室外聯(lián)系的電話應放置在醒目位置,并且放置在便于實驗室人員快速拿起的位置;
G、實驗室應該具有防止昆蟲和其他動物進入的措施。
十二、PCR實驗室管理
(1)嚴格控制進出實驗室的人員。與實驗無關的人員不得隨意進出實驗室,有條件的情況下要設置獨立的通道和進出整個實驗區(qū)的門;
(2)盡量減少在實驗區(qū)內(nèi)不必要的走動以減少交叉污染的可能性;
(3)擴增產(chǎn)物分析區(qū)是最主要的擴增產(chǎn)物污染來源,廢液不能在實驗室中傾倒,必須經(jīng)消毒液浸泡消毒后在遠離實驗室的地方棄掉,用過的吸頭等一次性材料也應經(jīng)消毒液浸泡消毒后統(tǒng)一處理,如焚燒等;
(4)擴增產(chǎn)物分析區(qū)可能會用到某些可致基因突變和有毒物質(zhì),應特別注意實驗人員的安全防護。
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